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在線工具一般具有“功能強大、操作簡單、無需安裝、用完就走”的特點，因此深受科研人員的喜愛。生信自學網在這里做個簡單的整理。 RNA二級結構 1、Mfold 工具鏈接： http://unafold.rna.albany.edu/?q=mfold  2、RNAfold 工具鏈接： http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi  3、蛋白互作網絡 String 工具鏈接： https://string-db.org/  學習PPI網絡構建，可以學習生信自學網專利課程： 《蛋白互作和共表達網絡構建》 4、基因共表達網絡 Coexpedia 工具鏈接： http：//www.coexpedia.org/  5、序列Motif MEME 工具鏈接： http://meme-suite.org/  6、Weblogo 工具鏈接： http://weblogo.threeplusone.com/  7、基因信息查找 Genecard 工具鏈接： http://www.genecards.org  8、序列展示 ESPript 工具鏈接： http://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi  9、Gene ID轉化 BioMart 工具鏈接： http://www.ensembl.org/index.html  TCGA數據庫用的是ensembl ID，在分析的時候需要轉換為GENE symobl，可以學習生信自學網的課程： 《TCGA基礎課程差異分析生存分析》 10、g:profiler 工具鏈接： https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/convert  11、韋恩圖 Venny2.0 工具鏈接： http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html  12、OmicShare 韋恩圖工具 工具鏈接： http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/venn  13、三元圖 Ternary plot maker 工具鏈接： https://www.ternaryplot.com/  14、基因結構分析 FGENES 工具鏈接： http://softberry.com/ 范例結果：   15、系統發育分析 iTOL 工具鏈接： https://itol.embl.de/  16Evolview 工具鏈接： http://www.evolgenius.info/evolview/  17、啟動子預測 Promoter Scan 工具鏈接： http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/  18、蛋白一級結構預測 PredictProte 工具鏈接： https://www.predictprotein.org/home  19、ProtParam tool 工具鏈接： http://web.expasy.org/protparam/  20、信號肽預測 SignalP 工具鏈接： http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/  21、跨膜結構域 TMHMM Server v. 2.0 工具鏈接： http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/   22、亞細胞定位 PSORT 工具鏈接： https://www.psort.org/  23、蛋白三級結構預測 SWISS-MODEL 工具鏈接： https://swissmodel.expasy.org/  24、Phyre2 工具鏈接： http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index  25、短序列拼接 Cap3 工具鏈接： http://doua.prabi.fr/software/cap3  26 、GO富集分析 OmicShare GO富集分析工具 工具鏈接： http://www.omicshare.com/tools/home/report/goenrich.html  27、KEGG富集分析 OmicShare KEGG富集分析工具 工具鏈接： http://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html  28、趨勢分析 OmicShare 趨勢分析工具 工具鏈接： http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/trend  29、蛋白結構域預測 Pfam 工具鏈接： http://pfam.xfam.org/search  30、基因組雜合性評估 GenomeScope 工具鏈接： http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2  31、圈圖 CIRCOS 工具鏈接： http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/  生信自學網推薦精品課程： 《單基因挖掘套路基于TCGA數據庫》 《TCGA腫瘤突變負荷》 《GTEx數據庫聯合TCGA數據庫挖掘》 《中藥復方網絡藥理學》 責任編輯：樂偉 作者申明：本文版權屬于生信自學網（微信號：18520221056）未經授權，一律禁止轉載！ 
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