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蛋白互作&表達相關性&共表達網絡一個課程搞定

時間:2018-03-13 14:18來源:原創 作者:森莘 點擊:
GEO芯片分析,得到差異基因,如果分析差異基因相關性,除了可以做GO、KEGG富集分析,接下來最值得分析的就是蛋白互作網絡,學習簡單高效,在論文里面經常出現,蛋白互作網絡構建

GEO芯片分析,得到差異基因,如果分析差異基因相關性,除了可以做GO、KEGG富集分析,接下來最值得分析的就是蛋白互作網絡,學習簡單高效,在論文里面經常出現,蛋白互作網絡構建一般用String在線工具,結合cytoscape的MCODE包獲取核心網絡。

TCGA數據庫差異分析也可以得到差異基因,如何分析兩個基因之間的相關性,可以做基因相關形分析;當然也可以做蛋白互作網絡構建。

WGCNA包的使用非常重要,用于分析基因模塊分類,也是論文中非常常見的分析。

如果需要學習蛋白互作網絡構建、基因相關性分析、WGCNA包的使用,接下來的這個課程一定適合您:《蛋白互作網絡與共表達網絡

如果對GEO、TCGA基礎還不了解,請先學習《GEO基礎課程》、《TCGA基礎課程

當然也可以選擇網易云課堂在線學習:生物信息學
1、蛋白互作網絡

2、基因相關性

3、WGCNA

4、cytoscape

好的數據分析,怎么少得了可視化,Cytoscape是共表達作圖神奇,一個專業的Cytoscape課程是畫圖的保障,學習《Cytoscpae軟件操作


責任編輯:樂偉
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