QQ登錄

只需一步,快速開始

使用微信賬號登錄

查看: 3170|回復: 0
打印 上一主題 下一主題

TCGA數據庫腫瘤微環境挖掘

  [復制鏈接]

該用戶從未簽到

31

主題

42

帖子

252

積分

管理員

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

積分
252
樓主
跳轉到指定樓層
發表于 2019-3-25 13:41:28 | 只看該作者 回帖獎勵 |倒序瀏覽 |閱讀模式
生信自學課堂
TCGA數據庫腫瘤微環境挖掘
--生信自學網
       生信自學網新視頻上線,按照5分多的文章套路講解,需要的趕緊收下。
      腫瘤微環境是腫瘤細胞所處的細胞環境,其組成包括細胞外基質、可溶性分子和腫瘤基質細胞。腫瘤微環境一旦形成,眾多免疫細胞,如T細胞、髓源抑制性細胞,巨噬細胞等,都被趨化至此,構成腫瘤的微環境。
       在腫瘤微環境中,免疫細胞和基質細胞是兩種主要類型的非腫瘤組分,并且已被提出對于腫瘤的診斷和預后評估是有價值的。
      ESTIMATE (Estimation of STromal andImmune cells in MAlignant Tumor tissues using Expression data) is a tool forpredicting tumor purity, and the presence of infiltrating stromal/immune cellsin tumor tissues using gene expression data. ESTIMATE algorithm is based onsingle sample Gene Set Enrichment Analysis and generates three scores:
1.     stromal score (that capturesthe presence of stroma in tumor tissue).
2.     immune score (that representsthe infiltration of immune cells in tumor tissue).
3.     estimate score (that inferstumor purity).

?  There was a positive correlation between stromal and immune scores.
?  samples with low tumour purity showed high stromal and immunescores.
?  ESTIMATE scores showed an increased correlation with tumour puritycompared with stromal-only and immune-only scores.  

課程購買鏈接1:
https://item.taobao.com/item.htm?spm=a230r.1.14.1.54ba32af5oW7LV&id=586808734105&ns=1&abbucket=5#detail
課程購買鏈接2: (生信自學網)
http://www.hbnisg.live/shop/biovideo-181.html





本帖子中包含更多資源

您需要 登錄 才可以下載或查看,沒有帳號?立即注冊

x
分享到:
回復

使用道具 舉報

您需要登錄后才可以回帖 登錄 | 立即注冊

本版積分規則

客服熱線
18520221056(微信) 周一至周日:09:00 - 22:00
公司官網:http://www.hbnisg.live

速科生物是一家融生信創新、設計、技術開發、服務為核心的生物公司,生信自學網專注于生信培訓周邊課程開發和代碼設計,堅持為客戶打造高品質的精品課程和培訓服務。

Powered by 生信自學網 © 2016-2019 江西速科生物

QQ|生信自學論壇 ( 贛ICP備19001400號-1 )

GMT+8, 2019-11-22 13:22 , Processed in 0.157334 second(s), 25 queries .

快速回復 返回頂部 返回列表
12134期6场半全场