知識的價值不在于占有,而在于使用。

生信自學網-速科生物-生物信息學數據庫挖掘視頻教程

當前位置: 主頁 > 生信數據庫 >

METABRIC數據下載乳腺癌數據

時間:2019-12-24 07:23來源:生信自學網 作者:樂偉 點擊:
METABRIC數據下載乳腺癌數據
數據下載
網址:http://www.cbioportal.org/
1、進入官網,點擊“Data SET” 菜單

2、進入數據頁面,在搜索框輸入“metabric”

3、點擊下載按鈕,就可以把數據下載下來,METABRIC數據庫只有乳腺癌的數據,所以下載數據非常簡單
有學員會有以為,如果METABRIC數據庫只有乳腺癌的數據,那么是不是只能做一次分析,剩下的都會重復,其實不然,我們課程用的是單基因篩選的方法,最后得到很多基因,然后根據自己的分析選擇其中一個基因就可以做后續分析了。

4、接下來我們看下下載好的數據
Data_CNA.txt 拷貝數數據
Data_mRNA_median_Zscores.txt 表達數據(用Zscores方法矯正后的數據)
Data_clinical_patient.txt、data_clinical_sample.txt 保存了臨床數據

那么我們新推出的課程用到的就是表達文件和臨床文件
精品課程推薦:
《TCGA轉錄組和甲基化聯合分析》
《TCGA免疫預后相關基因挖掘》
《GEO芯片聯合中藥復方網絡藥理學》



責任編輯:樂偉
作者申明:本文版權屬于生信自學網(微信號:18520221056)未經授權,一律禁止轉載!
加生信自學網群
BioWolf二維碼生成器
頂一下
(1)
100%
踩一下
(0)
0%
------分隔線----------------------------
發表評論
請自覺遵守互聯網相關的政策法規,嚴禁發布色情、暴力、反動的言論。
評價:
表情:
用戶名: 驗證碼:點擊我更換圖片
TCGA腫瘤微環境
推薦內容
單基因發文套路
m6A